Post Doctorant en évolution expérimentale (H/F)

Centre National de la Recherche Scientifique

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :

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Date Limite Candidature : lundi 3 avril 2023

Informations générales

Intitulé de l’offre : Post Doctorant en évolution expérimentale (H/F)
Référence : UMR9191-ARNLER-003
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : GIF SUR YVETTE
Date de publication : lundi 13 mars 2023
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d’embauche prévue : 1 septembre 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2900€ et 3300€ brut mensuel en fonction de l’expérience
Niveau d’études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
Section(s) CN : Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés

Missions

Les organismes réagissent à leur environnement en ajustant l’expression de leur gènes. Ce processus a lieu à deux échelles de temps radicalement différentes: au cours de la vie de l’individu, et à l’échelle évolutive, en conséquence de l’adaptation. Nous cherchons à comprendre comment ces deux processus interagissent, et comment la structure des réseaux de régulation des gènes contraint ou facilite la réponse à des environnements changeants.

Notre espèce modèle est Zymoseptoria tritici, un champignon pathogène de plantes qui peut être cultivé de manière clonale en laboratoire. Des expériences prédédentes chez cette espèce nous ont permis de montrer que l’adaptation à des conditions de température (fraiches, chaudes, ou fluctuantes) était rapide. Le séquençage des ARN avant et après l’évolution expérimentale ont mis en évidence une évolution profonde du transcriptome, dépendant du traitement expérimental. De manière remarquable, des milliers de gènes ont gagné ou perdu une sensibilité à la température (plasticité phénotypique) au cours de l’expérience.

L’objectif de ce projet post-doctoral est de mettre en place, de réaliser, et d’analyser une série d’expériences évolutives dans lesquelles différents facteurs environnementaux (comme la température, le milieu nutritif, ou la présence de différentes molécules) sont manipulés pour distinguer les rôles de l’adaptation, de la plasticité, et des contraintes génétiques sur l’évolution du transcriptome. Parmi les questions à aborder, on peut lister (1) Comment des scénarios environnementaux complexes affectent l’évolution du transcriptome, (2) Comment les co-expressions initiales contraignent la réponse plastique et la réponse évolutive, ou (3) est-ce que la plasticité d’expression est une propriété générale d’un transcriptome, ou est-elle spécifique d’un ou plusieurs facteurs environnementaux?

Activités

- Mise en place d’une série d’expériences d’évolution destinées à répondre aux questions scientifiques du projet

• Réalisation des expériences
• Préparation des échantillons pour séquençage
• Analyse bio-informatique et statistique des résultats
• Rédaction d’articles scientifiques
• Participation à la vie scientifique des équipes et des instituts

Compétences

Nous recherchons un biologiste de l’évolution motivé et autonome, détenteur d’une thèse obtenus après 2018. Une expérience préalable en évolution expérimentale (travail de laboratoire avec des micro-ou macro-organismes, biologie moléculaire de base, génétique des populations, bio-informatique) serait souhaitable.

Contexte de travail

Ce projet de post-doctorat est intégré à un projet de 3 ans financé par l’Agence Nationale pour la Recherche (ANR). Le consortium scientfique comprend, en plus du post-doctorant, deux chercheurs statutaires (Arnaud Le Rouzic, CNRS, et Anne Genissel, INRAE), une doctorante, et un technicien financé par l’ANR. Ce projet vise à comprendre et prédire l’évolution des transcriptomes sous sélection stable et fluctuante, en combinant des approches théoriques et expérimentales.

Le post-doctorant pourra interagir avec les deux porteurs du projet. Il/Elle sera administrativement basé(e) à l’EGCE (IDEEV, ?url=https%3A%2F%2Fwww.ideev.universite-paris-saclay.fr%2F&module=jobs&id=37580" target="_blank" rel="nofollow">?url=https%3A%2F%2Fwww.ideev.universite-paris-saclay.fr%2F&module=jobs&id=37580" target="_blank" rel="nofollow">https://www.ideev.universite-paris-­saclay.fr/), et mènera ses travaux expérimentaux à BIOGER (Agro-Campus). Les deux instituts proposent un cadre scientifique attractif; ils sont localisés à 3 km l’un de l’autre sur le nouveau campus de recherche de Paris-Saclay, à environ 35 km au sud de Paris.